Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms