Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms