Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms