Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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SvipQ3UZP4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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SvipQ3UZP4 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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SvipQ3UZP4 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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SvipQ3UZP4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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SvipQ3UZP4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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SvipQ3UZP4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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SvipQ3UZP4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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