Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms