Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm1123Q1RME4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms