Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cpne9Q1RLL3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cpne9Q1RLL3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cpne9Q1RLL3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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