Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms