Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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