Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcn1Q05186 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms