Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms