Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms