Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx2P81066 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms