Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms