Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms