Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms