Protein–RNA interactions for Protein: P27808

Mgat1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat1P27808 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mgat1P27808 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mgat1P27808 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms