Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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