Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms