Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AfpP02772 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AfpP02772 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AfpP02772 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AfpP02772 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AfpP02772 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AfpP02772 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AfpP02772 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AfpP02772 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AfpP02772 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AfpP02772 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AfpP02772 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AfpP02772 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AfpP02772 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AfpP02772 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AfpP02772 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AfpP02772 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AfpP02772 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AfpP02772 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AfpP02772 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms