Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01755 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01755 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms