Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms