Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Dnmt3bO88509 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms