Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb2O55203 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb2O55203 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms