Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms