Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms