Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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