Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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