Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm3542K7N6U2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm3542K7N6U2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm3542K7N6U2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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