Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms