Protein–RNA interactions for Protein: J3QMH4

Gm21866, Predicted gene, 21866, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21866J3QMH4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21866J3QMH4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21866J3QMH4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21866J3QMH4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21866J3QMH4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21866J3QMH4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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