Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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