Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms