Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r39G3UWE6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms