Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Phf11bB4XVQ1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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