Protein–RNA interactions for Protein: A8HG57

Gm21904, Predicted gene, 21725, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21904A8HG57 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21904A8HG57 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21904A8HG57 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21904A8HG57 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21904A8HG57 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21904A8HG57 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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