Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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