Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms