Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Shisal2aA2A9G7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisal2aA2A9G7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms