Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer3W4VSP1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer3W4VSP1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms