Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptgdr2Q9Z2J6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.7 ms