Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd1Q9Z2E2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mbd1Q9Z2E2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd1Q9Z2E2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd1Q9Z2E2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd1Q9Z2E2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms