Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd4Q9Z2D7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd4Q9Z2D7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mbd4Q9Z2D7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms