Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uso1Q9Z1Z0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uso1Q9Z1Z0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms