Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek4Q9Z1J2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek4Q9Z1J2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms