Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Skp2Q9Z0Z3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skp2Q9Z0Z3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skp2Q9Z0Z3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms