Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Nup160Q9Z0W3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Nup160Q9Z0W3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Nup160Q9Z0W3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Nup160Q9Z0W3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Nup160Q9Z0W3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Nup160Q9Z0W3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms