Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClcnkbQ9WUB6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClcnkbQ9WUB6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClcnkbQ9WUB6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms