Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfsf13bQ9WU72 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfsf13bQ9WU72 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfsf13bQ9WU72 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfsf13bQ9WU72 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms