Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn5Q9WU28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms